Geralmente NOOTRON é bem tolerado.
Pode ocorrer agitação psicomotora no início do tratamento, porém raramente. Podem, ainda, ocorrer efeitos neurológicos (cefaléias, convulsões, vertigens, sintomas extrapiramidais) e sintomas gastrintestinais (náuseas, vômitos, anorexia, diarréia ou constipação e gastralgias). Podem ocorrer perturbações funcionais digestivas.