Infecções bacterianas causadas por microorganismos sensíveis à amoxicilina: infecções das vias respiratórias altas e baixas; infecções do aparelho urogenital, incluindo as sexualmente transmissíveis. Outras infecções, entre elas, infecções intestinais, endocardites, infecções cirúrgicas e dermatológicas. Indicado na erradicação do Helicobacter pylori.

Como ocorre com os demais antibióticos penicilínicos, as reações adversas potenciais com o uso da amoxicilina são predominantemente alérgicas (hipersensibilidade) e ocorrem com muito maior freqüência nos indivíduos com história prévia de hipersensibilidade à penicilina, com asma, febre ou urticária. As reações de anafilaxia e hipersensibilidade muito raramente ocorrem após uso oral. As seguintes reações podem estar associadas ao uso de amoxicilina: reações cutâneas (eritematosas ou urticariformes), gastrintestinais (náusea, vômito e diarréia), hepáticas (aumento das transaminases), hematológicas (anemia, trombocitopenia, eosinofilia, leucopenia e agranulocitose). Estas reações, de hipersensibilidade ou por intolerância, são habitualmente reversíveis com a suspensão da terapia com amoxicilina. É possível a ocorrência de alergia cruzada com a penicilina G, outras penicilinas semi-sintéticas e cefalosporinas. Antes de se iniciar uma terapia com penicilina é necessária uma perfeita anamnese. No caso de ocorrer reação alérgica deve-se interromper o tratamento e instituir terapêutica apropriada (anti-histamínicos, corticosteróides) ou, em caso de anafilaxia, tratamento imediato com adrenalina ou outras medidas de emergência. Nos casos de tratamentos prolongados, com doses elevadas, é necessário um controle periódico hemático, hepático e renal. Reações do sistema nervoso central, tais como, agitação, hiperatividade, ansiedade, insônia, vertigem e confusão mental são raramente relatadas.